Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NMD3Q96D46 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms