Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KCTD12Q96CX2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
KCTD12Q96CX2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms