Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RHBDF1Q96CC6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RHBDF1Q96CC6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms