Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NSUN4Q96CB9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSUN4Q96CB9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 244.2 ms