Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC127Q96BQ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC127Q96BQ5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms