Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VTI1AQ96AJ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VTI1AQ96AJ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms