Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP1MTQ969P6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TOP1MTQ969P6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms