Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EDAQ92838 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EDAQ92838 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EDAQ92838 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDAQ92838 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDAQ92838 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDAQ92838 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EDAQ92838 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDAQ92838 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EDAQ92838 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EDAQ92838 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EDAQ92838 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EDAQ92838 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EDAQ92838 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EDAQ92838 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EDAQ92838 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EDAQ92838 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EDAQ92838 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EDAQ92838 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms