Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RABGGTAQ92696 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABGGTAQ92696 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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