Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERVK_113Q902F9 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms