Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SFT2D1Q8WV19 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SFT2D1Q8WV19 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms