Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HELQQ8TDG4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HELQQ8TDG4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HELQQ8TDG4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms