Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71BQ8TC56 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71BQ8TC56 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms