Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LINC00301Q8NCQ3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms