Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DNAAF3Q8N9W5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DNAAF3Q8N9W5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms