Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NPAS3Q8IXF0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NPAS3Q8IXF0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms