Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HERC6Q8IVU3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms