Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASSF3Q86WH2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RASSF3Q86WH2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms