Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPFIBP1Q86W92 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPFIBP1Q86W92 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms