Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBE2Q1Q7Z7E8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UBE2Q1Q7Z7E8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.9 ms