Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CATSPER4Q7RTX7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CATSPER4Q7RTX7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms