Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAPN12Q6ZSI9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CAPN12Q6ZSI9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms