Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ZCCHC12Q6PEW1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ZCCHC12Q6PEW1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms