Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ALKBH2Q6NS38 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms