Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CARMIL2Q6F5E8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CARMIL2Q6F5E8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms