Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LHX8Q68G74 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX8Q68G74 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms