Protein–RNA interactions for Protein: Q66K89

E4F1, Transcription factor E4F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4F1Q66K89 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
E4F1Q66K89 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
E4F1Q66K89 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms