Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW22

AGAP6, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP6Q5VW22 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
AGAP6Q5VW22 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
AGAP6Q5VW22 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms