Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ATAD3CQ5T2N8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ATAD3CQ5T2N8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms