Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCID2Q5JVF3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCID2Q5JVF3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms