Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC92Q53HC0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC92Q53HC0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms