Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PKDCCQ504Y2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PKDCCQ504Y2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms