Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LONRF3Q496Y0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LONRF3Q496Y0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms