Protein–RNA interactions for Protein: Q401N2

ZACN, Zinc-activated ligand-gated ion channel, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZACNQ401N2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZACNQ401N2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZACNQ401N2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZACNQ401N2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZACNQ401N2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZACNQ401N2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZACNQ401N2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZACNQ401N2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZACNQ401N2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms