Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PUS10Q3MIT2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PUS10Q3MIT2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms