Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ANKRD55Q3KP44 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ANKRD55Q3KP44 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms