Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TSNAXIP1Q2TAA8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TSNAXIP1Q2TAA8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms