Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TYSND1Q2T9J0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TYSND1Q2T9J0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms