Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERCC6LQ2NKX8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms