Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTC1Q2NKJ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTC1Q2NKJ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms