Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC27Q2M243 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC27Q2M243 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms