Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
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PTPRNQ16849 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
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PTPRNQ16849 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRNQ16849 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRNQ16849 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRNQ16849 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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PTPRNQ16849 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.27■■□□□ 1
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PTPRNQ16849 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRNQ16849 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRNQ16849 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRNQ16849 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRNQ16849 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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PTPRNQ16849 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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PTPRNQ16849 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRNQ16849 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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PTPRNQ16849 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRNQ16849 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRNQ16849 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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PTPRNQ16849 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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PTPRNQ16849 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRNQ16849 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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PTPRNQ16849 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPRNQ16849 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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