Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPP1Q16831 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UPP1Q16831 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms