Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
NRF1Q16656 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NRF1Q16656 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms