Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SNAPC1Q16533 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SNAPC1Q16533 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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SNAPC1Q16533 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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