Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSMD5Q16401 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSMD5Q16401 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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