Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SHHQ15465 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHHQ15465 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHHQ15465 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SHHQ15465 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SHHQ15465 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SHHQ15465 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SHHQ15465 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHHQ15465 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SHHQ15465 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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