Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SF3A2Q15428 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SF3A2Q15428 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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