Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PTPRRQ15256 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PTPRRQ15256 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPRRQ15256 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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