Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KARSQ15046 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KARSQ15046 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KARSQ15046 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KARSQ15046 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KARSQ15046 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KARSQ15046 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KARSQ15046 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KARSQ15046 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KARSQ15046 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KARSQ15046 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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